El museo dispone de un auditorio y de una biblioteca especializada en la historia de Cataluña.
La exposición permanente muestra de forma innovadora la historia de Cataluña, desde la prehistoria hasta nuestros días, distribuida cronológicamente en 8 etapas.
✔ Las raíces. Desde el Paleolítico inferior al final de la época romana (prehistoria - siglo VIII).
✔ El nacimiento de una nación. La Reconquista y la expansión política y territorial (siglos VIII-XIII).
✔ Nuestro Mar. La expansión militar y mercantil por el Mediterráneo (siglos XIII-XVI).
✔ En la periferia del Imperio. La Guerra de los Segadores, la Guerra de Sucesión y el Decreto de Nueva Planta (siglos XVI-XVIII).
✔ Vapor y nación. De la revolución industrial al modernismo (siglos XVIII-XIX).
✔ Los años electricos. Del movimiento obrero a la Guerra Civil (de 1900 a 1939).
✔ Derrota y recuperación. De la posguerra a la democracia (de 1940 a 1980).
✔ Retrato de la Cataluña contemporánea (de 1980 hasta nuestros días).
El Museo de Historia de Cataluña ocupa un sector de los antiguos Almacenes Generales de Comercio, un edificio típico de la arquitectura portuaria del siglo XIX, actualmente conocido como Palacio del Mar (Palau de Mar). Se trata de la única edificación que ha sido conservada del antiguo puerto industrial de Barcelona. Fue construido entre 1885 y 1900 siguiendo el proyecto del ingeniero Maurici Garrán, inspirado en los edificios portuarios ingleses de la época. En 1992 ha sido ampliamente restaurado y modernizado.